Pengulangan Genom Pendek Menunjukkan Afinitas Antara Babi Dan Primata

Video: Pengulangan Genom Pendek Menunjukkan Afinitas Antara Babi Dan Primata

Video: Pengulangan Genom Pendek Menunjukkan Afinitas Antara Babi Dan Primata
Video: REGRESI POLINOMIAL BERGANDA | DENGAN | DUMMY DAN INTERAKSI 2024, Maret
Pengulangan Genom Pendek Menunjukkan Afinitas Antara Babi Dan Primata
Pengulangan Genom Pendek Menunjukkan Afinitas Antara Babi Dan Primata
Anonim
Pengulangan singkat dalam genom menunjukkan hubungan antara babi dan primata - babi, babi, primata
Pengulangan singkat dalam genom menunjukkan hubungan antara babi dan primata - babi, babi, primata
Gambar
Gambar

Ilmuwan menemukan di genom babi keluarga pengulangan pendek yang unik dengan kesamaan evolusioner dengan pengulangan serupa pada primata.

Ilmuwan dari Universitas Jilin (Changchun, Cina) dan Akademi Ilmu Pertanian (Heilongjiang, Cina) mengambil bagian dalam proyek ini bekerja sama dengan Firefly BioWorks Corporation (AS).

Setelah menganalisis struktur dan asal PRE-1 (elemen pengulangan babi, secara harfiah - "elemen pengulangan babi"), mereka sampai pada kesimpulan bahwa kerabat terdekat primata di bekas superbenua Laurasia bisa jadi adalah babi. Pracetak penelitian diterbitkan di server bioRxiv pada 31 Agustus 2015.

CDP (shortdispersid repeat) PRE-1 yang dipelajari terletak di wilayah intergenik, sekitar 686 ~ 985 pasangan basa sebelum dimulainya gen yang mengkode protein pengikat faktor pertumbuhan insulin (IGFBP7). Urutan PRE-1 berulang dari 299 pasangan basa dibandingkan dengan 40 pengulangan Alu primata yang berbeda, dan kesamaan yang signifikan ditemukan baik dalam urutan itu sendiri maupun dalam pola distribusi pengulangannya di seluruh kromosom.

Struktur sekunder yang diprediksi dari pengulangan RNA PRE-1 dilipat menjadi model yang mirip dengan pengulangan Alu. Akhirnya, asal usul yang sama dari PRE-1 dan Alu dari apa yang disebut 7SL RNA (signal recognition RNA) menunjukkan kesamaan evolusioner mereka dan mengaitkan babi dengan keluarga, yang terutama mencakup primata.

Sebelumnya, untuk membangun pohon filogenetik, para ilmuwan hanya mengandalkan persamaan dan perbedaan gen, mengabaikan fakta bahwa selama evolusi, seluruh genom mengalami perubahan, termasuk elemen-elemen yang tidak mengkodekan protein atau RNA dan artinya adalah sebagian besar masih belum jelas bagi para ilmuwan.

Studi ini, berdasarkan pendekatan terpadu untuk analisis elemen intergenik, memberikan, menurut penulis, fakta "sangat meyakinkan" dari mana kesimpulan evolusi dapat ditarik. Secara khusus, menurut hasil ini, perkiraan waktu divergensi spesies bergeser dari 65 menjadi 80-100 juta tahun yang lalu.

Direkomendasikan: